化石燃料是岩石圈中因埋藏而暂时离开碳循环的有机质

化石燃料是岩石圈中因埋藏而暂时离开碳循环的有机质
　　二氧化碳是各种生物通过发酵、含氧或缺氧呼吸制造能量时的一种产物。另一个例子是甲烷一旦进入氧化环境，就有可能被噬甲烷菌氧化成二氧化碳。有关这些不同生物的详细资料可参阅任何关于微生物新陈代谢的近期论述。
　　化石燃料是岩石圈中由于埋藏作用而暂时脱离碳循环的有机质，沉积作用和早期的埋藏作用导致了原始有机物质被异养型生物的降解作用和其他的一些作用，如化学氧化作用破坏殆尽。所有的化石燃料，如高度分散的有机质、煤和石油均可被看作是由于埋藏的缘故而置身于非常高效的碳循环之外的剩余有机碳。这些剩余有机碳只是碳循环中极小的一部分。据估计在地史中，植物(初始生产率)形成的生物物质的碳约有0．1％保存在沉积物中并可为石油生成的相关过程所利用。在海相盆地中大约有0．6％的生成的有机碳被保存了下来。最终，作为储集有机碳的化石燃料通过变质、抬升、剥蚀和燃烧等作用又回到了碳循环之中。前已述及，有机质包括生物标志化合物，只有在特殊的条件下才能很好地被保存在沉积物中。